Szkoła Nr 21 została zbudowana w roku 1936. Liczyła 10 sal lekcyjnych. Nie posiadała sali gimnastycznej ani żadnego innego, większego pomieszczenia. Kierownikiem tej szkoły była Maria Niemczykowa, a od 1938 pracował tutaj jako nauczyciel Janusz Kusociński.

W czasie wojny placówka istniała do powstania. Niemcy przed opuszczeniem Warszawy szkołę i całą dzielnicę zburzyli petardami. W 1945r., poczęła wracać na gruzy Bielan ludność, równocześnie Eugeniusz Jankowski w marcu rozpoczął reorganizację szkoły. Przez pewien czas sale lekcyjne mieściły się w prywatnych domach.                E. Jankowski z grupami starszej młodzieży i rodzicami uczniów przyczynił się wybitnie do odbudowy gmachu.

W roku szkolnym 1945/46 wróciła z tułaczki dawna kierowniczka szkoły - Maria Niemczykowa. Wtedy też w budynku przy ulicy Zuga umieszczono dwie placówki - na parterze, w pięciu salach pozostała szkoła nr 21, a na piętrze rozpoczęła pracę szkoła nr 5. Taki stan rzeczy trwał do roku szkolnego 1954/55, kiedy "piątka" przeniosła się do nowego budynku. Gmach przy ulicy Zuga powiększono o jeden pawilon, drugie piętro i salę gimnastyczną. W roku szkolnym 1961/62 nadano szkole imię Janusza Kusocińskiego.

Kolejnymi kierownikami szkoły byli: E. Jankowski, M. Niemczykowa,   A. Maciejczyk, S. Pasterz, A. Składowa, J. Tymińska.

W 1975 roku utworzono Zespół Szkół Ogólnokształcących Mistrzostwa Sportowego, który w 1995 roku otrzymał imię Janusza Kusocińskiego.